Модель CBR600RR 2013 года получает 12-спицевые колеса. Также CBR600RR получает улучшенные настройки ЭБУ и системы впрыска топлива и тонко настроенную систему забора набегающего потока воздуха для увеличения мощности на средних оборотах и улучшения реакции дросселя на высоких оборотах.

Мотоцикл также получает переднюю вилку Showa "Big Piston Fork" (BPF) с диаметром перьев 41 мм оснащённую большим поршнем который создает амортизирующие силы при более низком давлении внутри, для обеспечения более плавной и быстрой работы. Новая вилка регулируется по преднатягу, а также имеет регулировки сжатия и отбоя. Задняя подвеска Pro-Link® получила обновленный амортизатор с полным пакетом настроек для улучшения характеристик.

При расчете аэродинамики CBR600RR производитель использовал опыт полученный из гоночной программы Honda RC212V MotoGP. Изменения внесенные в обтекатель снизили аэродинамическое сопротивление на 6,5% по сравнению с CBR600RR 2009 года. В свою очередь, в ходе разработки и тестировании обтекателя CBR600RR были получены наработки, который были применены к текущему гоночному мотоциклу RC213V MotoGP. Обнаруженная аэродинамическая эффективность, в ходе исследований, обеспечила лучшее управление и лучшее обтекание встречного потока для повышения удобства водителя.